當玩家在二周目的時候游戲流程進行到男主角死亡之后就可以進入這個特有的龍之圣域地圖了。

入口在六千五百萬年前和公元六百年的地圖中部的時空斷層，在進入六千五百萬年前的地圖會觸發劇情都是全部消滅北之森的怪物之后（中世紀的起初進到龍之圣域同樣是先要全消北之森的怪物），就可以接受龍之圣域居民的任務了。

        黃金巴庫任務

從村民的對話中得知一個叫黃金之樹的地方才會有黃金巴庫聚集，而黃金之樹的幼苗在成長中則需要在黃金之沙中培育，同時黃金之沙又只在南方的大濕原的花田之中才有。

先到下方的大濕原找到黃金之沙，然后到北之森的最深處找到樹苗，這時在把黃金之沙撒到樹苗的周圍以后，再到公元六百年的龍之圣域（地圖方位是一樣的），就可一找到黃金巴庫，來到這里后出現劇情，之后黃金巴庫就會逃跑，按原路返回就會再次發現黃金巴庫與之戰斗勝利后就能得到黃金巴庫（戰斗無難度），之后在回到六千五百萬年前就可以完成任務了。

        虹之源石任務（六千五百萬年前）

接到任務后進入位于大濕原東邊的的綠山，剛進去就會遇到怪物擋道，一番勸說后無用，只能開打了（在消滅BOSS的那一剎BOSS會使用瀨死攻擊，只要加好血，難度根本沒有）。勝利后怪物離開了，一路上山到最頂處就能得到虹之源石了，回村交任務后，任務完成。

       源石的秘密任務（六千五百萬年前）

得到虹之源石后到最右邊的樓梯旁與怪物對話，知道在祭壇（村子中間最上方）的兩個祭臺上都放上虹之源石，就可以得到幻之石的消息，同時得到任務。先到上方祭壇的一個祭臺放上源石后，來到位于公元600年的中世紀，到村長處與之對話得知要進入祭壇，就必須到北之森的龍人之證。眾人只有再次進入北之森了，在最深處找到了龍之證明（發光點），然后就可以進入祭壇了，把原先放在祭臺上的源石取下來。現在又返回六千五百萬年前的原始社會，在原始的另一個祭臺上放上源石，兩顆源石就會合成秘寶珠，與怪物對話后，任務完成。然后到綠山的最頂端，把秘寶珠放到原來取得虹之源石的地方吸收日月精華，再到中世紀就可以取到引導的寶珠

        洞窟調查任務（六千五百萬年前，前提是必須得到引導的寶珠才能觸發這個任務）

與右下方的怪物對話，可知道引導的寶珠可以照亮大濕原西方的洞窟的黑暗之洞，照亮洞窟后會發生戰斗，之后知道怪物準備要攻擊龍之里，回村子告訴大家后，全村的人都做好了開戰的準備，主角得到了魔王的武器，和雜物店的老板對話會得到物品。現在又一次到洞窟去，一路殺到地下城堡，就會發生BOSS戰了。

BOSS是一個冰火兩個屬性的惡魔龍，BOSS的整體實力并不強，但只要一方死亡，另一方就會在一段時間內使用魔法使另一方復活，如果不能把握時間把BOSS同時殺死，就會陷入BOSS無限復活的戰斗中。戰勝后，龍之里的人們都得救了，當然主角們也成為了這些人眼中的英雄。2